V roce 1760 bylo Židům povoleno postavit synagógu. Byl postaven z finančních prostředků místních a dalších korligionistů. Mělo to barokní rysy. Jeho rekonstrukce a rozšíření v roce 1860 dostalo pseudogotický charakter. Rozšíření zahrnovalo také rabínský byt, ženskou galerii a rituální koupel „mikve“. Hlavní sál byl určen pouze mužům, každý tam měl předplacené místo. Kolem roku 1870 byla na východní stranu přidána apsida pro pěveckou skupinu Sir Zion.
V roce 1886 zasáhlo židovské město požár a vyhořela také synagoga. Byl přestavěn do svého současného vzhledu v původním rozvržení. Židovská komunita vlastnila tři vzácné Thory a četné stříbrné ceremoniální vybavení.
Během nacistické okupace bylo všechno odvezeno do Prahy a dnes tvoří světově proslulé expozice židovského muzea. Po násilném převozu Židů za 2. světové války byla budova demolována, okna rozbita, vytáhnuta podlaha a zmizel nábytek.
V roce 1952 husitský kostel Humpolec koupil tuto pustou budovu od židovské komunity, v následujícím roce byla zahájena rekonstrukce. Dne 21. 05. 1961 byla slavnostně otevřena celá budova. V letech 1987-1989 byl opraven interiér i experiment a v hlavní síni modlitby byly odkryty barevné fragmenty původních dekorací a hebrejských titulů, které byly stále čitelné.
